Отдел был создан 12 октября 2003 г. – в этот день состоялось официальное открытие Пермского филиала по исследованию политических институтов и процессов Института философии и права УрО РАН – единственного за пределами Москвы академического центра политической науки. В 2013 г. произошла реорганизация академических учреждений, и филиал был преобразован в отдел по исследованию политических институтов и процессов Пермского федерального исследовательского центра Уро РАН.